По переписи населения 1939 года в СССР насчитывалось 75 763 карачаевца, из которых 70 301 человек проживал в Карачаевской автономной области, составляя 46,8% населения. В середине августа 1942 года на эту территорию вступили немецкие войска. Уже в первый период оккупации Карачаевская область понесла значительный ущерб в людских и материальных ресурсах. Были замучены и расстреляны многие русские, карачаевцы, осетины, абазины и представители других народов. Уничтожено 150 тыс. голов скота, разрушены предприятия, превращены в конюшни местные школы.

В январе 1943 года область освободили от немецких войск. Свои неудачи в первые месяцы и годы войны советская власть объявила следствием действий «предателей и врагов народа». Указом ПВС СССР № 115/13 от 12 октября 1943 года «О ликвидации Карачаевской автономной области и об административном устройстве её территории» было поставлено задание переселить всех карачаевцев в другие районы СССР, а Карачаевскую автономную область ликвидировать. Ее территория была разделена между соседними субъектами и предлагалась к заселению «проверенными категориями трудящихся».

Депортация карачаевцев была осуществлена 2—5 ноября 1943 года. Для силового обеспечения выселения были задействованы войсковые соединения численностью в 53 327 человек. Всего было отправлено 34 эшелона, 2000–2100 человек в каждом, вагонов было около 58 в каждом, последние 3 состава вышли 5-го ноября и 19-го были ещё в пути…

В своих воспоминаниях Анастас Микоян, верно служивший советской власти и построивший карьеру от секретаря Северокавказского крайкома ВКП(б) до председателя Президиума Верховного совета СССР, так охарактеризовал принятое Сталиным решение о тотальной депортации народов:

«…В течение суток-двое загружались вагоны и отправлялись в другие места. Была такая высокая организованность, которую, конечно, нужно было бы применять в другом деле, а не в таком позорном…

Удручающее впечатление на меня произвело то, что Сталин добился выселения целых народов — чеченцев, ингушей, калмыков, карачаевцев, балкар, кабардинцев, немцев Поволжья и других — с их исконных земель в европейских районах и в Закавказье, а также татар из Крыма, греков из Закавказья уже после того, как немцы были изгнаны с территорий, где проживали эти народы.

Я возражал. Но Сталин объяснял это тем, что народы были нелояльными к Советской власти, сочувствовали немецким фашистам. Я не понимал, как можно было обвинять целые народы чуть ли не в измене, ведь там же есть партийные организации, коммунисты, масса крестьян, советская интеллигенция! Было много мобилизовано в армию, воевали на фронте, многие представители этих народов получили звания Героев Советского Союза! Но Сталин был упрям. И он настоял на выселении всех до единого с обжитых этими народами мест…», — писал Микоян.

В Среднюю Азию были депортированы не только те карачаевцы, которые волею судьбы оказались в немецкой оккупации. Впоследствии из армии увольнялись все военнослужащие карачаевской национальности и также отправлялись в ссылку на спецпоселения. Вместе с репрессированными народами были выселены некоторые представители других народов, чья депортация не предусматривалась.

О скорбной дате в истории карачаевцев вспоминают в соцсети Фейсбук представитель Чеченской Республики Ичкерия в Эстонии, назначенный еще во времена первого президента Ичкерии Джохара Дудаева Имран Ахаев, Анар Гаджиев и многие другие пользователи:

В частности, Рамазан Узденов процитировал отрывок стихотворения, свидетельствующий о любви карачаевцев к родной земле:

…Однажды друга встретил с чемоданом.
— «Ну, что везешь? Успел богатым стать?»
— «Останки матери я вырыл» — он ответил,
— «Везу на Родину, чтоб их земле предать!»

— В 1943–44 годах, когда свыше 15 тысяч мужчин-карачаевцев сражались на фронтах Великой Отечественной войны, из Карачаево-Черкесии были депортированы около 70 тысяч стариков, женщин и детей. Они были вывезены на поселения в Казахстан и Киргизию. Большая часть репрессированных, а это 43 тысячи человек, в том числе 22 тысячи детей, погибли по дороге в местах переселения от голода, холода и болезней.

— В 1957 году карачаевцам разрешили вернуться на родину, первый эшелон на Северный Кавказ прибыл 3 мая.

— Российская империя показала свою сущность. Она всегда была коварной. И вот «белого царя» заменил «красный царь» , настало время новых испытаний для народов. Тиран Сталин, устроивший в Украине ужасный Голодомор в 1932–33 гг., вполне вероятно, задумывал тотальную депортацию и украинцев и других крупных народов, но переселение 50 млн человек — проект, оказавшийся технологически и технически непосильным даже ему. Поэтому имперская сила в 40-е годы была направлена против малых народов: Крыма, Северного Кавказа, Поволжья и т. д. К тому времени Казахстан, Украина, Прибалтика да и сама Россия пережила волну государственного террора: уничтожалась цвет нации и народов. Миллионы людей были осуждены, высланы или расстреляны. От безнаказанности коварная система перешла от отдельных людей на целые народы — чтоб «наказать»…

«Карачай — нейтральный народ, живущий у подошвы Эльбруса. Отличается верностью, красотой и храбростью», — когда-то сказал Л. Н. Толстой. Откуда было знать, что этот народ в будущем ждет много испытаний и трагедий? Но какие бы эти испытания не были, как бы ни были они заполнены коварными и жестокими сценами, врагам не удалось уничтожить этот мусульманский народ и они выжили по воле Аллаха, ибо дух у них сильнее оказался, чем у врага.

— Так случилось, что депортация стала неотъемлемой частью истории наших народов. Маленькие народности особенно испытали на себе имперский каток. В нескончаемом сталинском этапе в Сибирь и на Колыму шли и шли, теряя друзей и родных, целые семьи. И эта ссылка казалась нескончаемым бедствием. Но у тирана не получилась уничтожить целые народности. Силу духа не победить никогда. Пусть будет проклят любой тиран, империя и насилие! Пусть будет проклят Сталин и его команда. Гореть им всем в Аду иншаАллах.