29 марта Меджлис крымскотатарского народа подал жалобу в Европейский суд по правам человека (ЕСПЧ) в связи с тем, что российские власти включили его в список экстремистских организаций и запретили его деятельность.
В жалобе в ЕСПЧ Меджлис указал, что включение его в список экстремистских организаций и прекращение его деятельности нарушают статью 11 (свобода собраний и объединений) Европейской конвенции о защите прав человека и основных свобод. Кроме того, организацию запретили, а ее членов преследуют в связи с их политической позицией, что является нарушением статьи 18 (пределы использования ограничений в отношении прав). Меджлис также пожаловался, что российские суды не признают его статуса как представительного органа коренного крымского народа, тем самым нарушая статью 14 (запрет дискриминации). Члены Меджлиса также утверждают, что были лишены права на справедливое судебное разбирательство (статья 6) и что они не могли предположить, что их деятельность станет нарушать антиэкстремистское законодательство (статья 7 — наказание исключительно на основании закона).
Меджлис в ЕСПЧ представляют Правозащитный центр «Мемориал» (юридический директор Кирилл Коротеев, юристы Марина Агальцова и Татьяна Глушкова), Европейский центр защиты прав человека (EHRAC, Лондон) и Украинская Хельсинкская группа по правам человека.
Как напоминает Мемориал, в феврале 2016 года «прокурор» Республики Крым подал заявление в суд о признании Меджлиса экстремистской организацией. 26 апреля 2016 года так называемый Верховный суд Республики Крым признал Меджлис экстремистской организацией. Верховный суд РФ отклонил апелляционную жалобу Меджлиса 29 сентября 2016 года.
Для притеснения представителей крымскотатарского народа широко используется российское антитеррористическое и антиэкстремистское законодательство. Все больше людей обвиняют, часто — безосновательно, в том, что они являются членами «
Правозащитники задокументировали 18 насильственных исчезновений, которые до сих пор не расследованы. Тела нескольких активистов нашли со следами избиений и пыток.
Мустафе Джемилеву, бывшему председателю Меджлиса, и Рефату Чубарову, нынешнему его главе, запрещено въезжать на полуостров. Против них возбуждены уголовные дела. Нескольким членам организации угрожали, притесняли, преследовали их, десятеро из них обвинены в совершении административных правонарушений и уголовных преступлений, один находится в заключении.
Власти незаконно обыскивают мечети, исламские школы и частные дома крымских татар. Многие были вынуждены уехать на материковую Украину или Россию.
Несколько крымскотатарских СМИ запрещены, другие преследуются. Канал АTR — единственный канал, вещающий на крымскотатарском языке, — был вынужден прекратить деятельность, поскольку российские власти отказали ему в получении лицензии. Ранее сотрудники ФСБ угрожали сотрудникам телеканала, чтобы те прекратили передавать информацию о преследовании крымских татар и обысках в их домах. Газету Меджлиса «Авдет» выселили из здания, которое они занимали долгие годы, предварительно прокуратура прислала извещения, что в газете публикуются экстремистские материалы (например, призывы к бойкоту выборов и использование слов «аннексия» и «оккупация» по отношению к Крыму).
На рассмотрении ЕСПЧ находится около трех тысяч отдельных жалоб, имеющих отношение к событиям в Крыму и на Востоке Украины.